De gode bakteriene danner kolonier på substrat, de flyter ikke rundt i vannet. Siden filtermediene er det substratet som har størst overflate, finnes de aller fleste av dem der. Noe finnes også på andre overflater i akvariet....stein, røtter, grus etc.
Så det er helt trygt å bytte vann og "rense" filteret samtidig. Gjøres filter-rens riktig, påvirker det ikke bakteriekoloniene så mye.