Det er ikke "møkka" på bunnen som er problemet, men at det ikke er en stor nok bakteriekultur som kan bryte ned avfallsstoffene fra fisken samt rster av for.
Om du fjerner bunngrusen, vil du også fjerne bakterier, ettersom de fester seg ikke bare i filter, men også på sand/grus, røtter etc.
Vannbytter, vannbytter.