Ozon eller O3 kan godt brukes til desinfisering av ferskvann også, du trenger en reaktor og gjerne en motstrøms reaktor.
Ozon er svært giftig og må brukes med varsomhet. Og ozon bryter ikke ned organisk materiale, men brukes for å drepe eventuelle patogene organismer i f eks drikkevann. Erstatter dermed et UV filter.
